यूबीक्विटिन (यूबी) सर्वव्यापी है। यह छोटा, 76 अवशेष प्रोटीन यूबीक्विटिन प्रोटियोसोम प्रणाली (यूपीएस) द्वारा अपघटन के लिए सेलुलर प्रोटीन को चिह्नित करने के लिए उपयोग किया जाता है। दो प्रमुख एंजाइम परिवार,यूबी लिगाज़ और ड्यूबिक्विटाइलिंग एंजाइम (डीयूबी), इन यूबी इकाइयों को लगाने और हटाने के लिए जिम्मेदार हैं और कोशिका की समग्र प्रोटीन आबादी को नियंत्रित करते हैं। जैसा कि आप कल्पना कर सकते हैं, यह गतिशील प्रक्रिया महत्वपूर्ण है,और अनियमितता कई बुरी चीजों का कारण बन सकती हैइस प्रकार, DUB या Ub लिगाज़ गतिविधि और विशिष्ट बीमारियों के बीच संबंधों को समझना अवरोधकों या अन्य चिकित्सीय हस्तक्षेपों के डिजाइन में सहायक होगा।गतिविधि आधारित प्रोटीन प्रोफाइलिंग (ABPP) के लिए कई यूबी आधारित जांच विकसित की गई हैं।, आम तौर पर एन-टर्मिनस पर एक आत्मीयता टैग, जैसे हेमग्लुटिनिन (एचए) या बायोटिन और सी-टर्मिनस पर एक इलेक्ट्रोफिलिक वारहेड, जैसे प्रोपार्गीलामाइड (पीए), विनाइल मिथाइल एस्टर (वीएमई) शामिल है,या निर्जलीकरण (डीएचए)हालांकि, इनमें से कई जांच कम सेल घुसपैठ के कारण शुद्ध पुनर्मिलन प्रोटीन या सेल लिसेट्स के साथ प्रयोगों तक सीमित हैं।जांचकर्ताओं को वास्तव में कोशिकाओं में प्रवेश करने और एंजाइमों के साथ इंट्रासेल्युलर रूप से प्रतिक्रिया करने में सक्षम होना चाहिए ताकि दवा लक्ष्यीकरण और अन्य प्रयासों के लिए सबसे उपयोगी जानकारी प्राप्त हो सके.

• विभिन्न लंबाई और प्रकार की यूबिक्विटिन श्रृंखलाओं को जैव रासायनिक कार्यों जैसे इंटरैक्शन और एंजाइम गतिविधि के साथ-साथ क्रिस्टल के संरचनात्मक जीव विज्ञान अध्ययन के लिए लागू किया जा सकता है,इलेक्ट्रॉन माइक्रोस्कोप और परमाणु चुंबकीय अनुनाद.
• उबिक्विटिन से प्राप्त क्रॉस-लिंकिंग जांच का उपयोग सामान्य या बीमार कोशिकाओं से अज्ञात परस्पर क्रियाशील प्रोटीनों और रोग उपचार के लिए नए लक्ष्यों का पता लगाने के लिए किया जा सकता है।
• ड्यूबिक्विटाइनस की गतिविधि और विशिष्टता का विश्लेषण करने और ड्यूबिक्विटाइनस अवरोधकों की उच्च थ्रूपुट स्क्रीनिंग के लिए यूबिक्विटाइन-व्युत्पन्न फ्लोरोसेंट जांच का उपयोग किया जा सकता है।